1、外观有差别。符合新国标标准的电动自行车需要具备脚踏骑行能力，也就是说这样的电动车必须要有脚蹬子。但是电动摩托车在上牌时并没有规定说必须要有脚蹬子，有没有脚蹬子，并不影响电动摩托车车主办理上牌手续。
2、车辆参数有差异。电动自行车按照时速快慢、车身重量、电机功率、蓄电池额定电压等划分为非机动车和机动车，而电动摩托车并没有参数上的要求，无论是电动轻便摩托车还有电动摩托车均属于机动车。
3、办理手续项目不同。被归到非机动车的电动自行车只需要办理上牌手续，并不需要考取驾照。但是电动摩托车不仅要办理上牌手续，还需要考取驾驶证，同时还要缴纳车船税、交强险费用等，否则将不能办理上牌手续。
4、管理标准不同。电动自行车分为非机动车和机动车，管理标准有两种。电动摩托车被归为机动车一类，在管理时比较严格，一旦车主违反规定，不只要罚款，还可能被拘留和吊销驾照。